Epigenetische processen

In dit project willen we de epigenetische processen in kaart brengen die betrokken zijn bij het ontstaan van MRT. Door hier beter inzicht in te krijgen willen we in de toekomst gerichtere en effectievere behandelingen te ontwikkelen. We willen dit doen door gebruik te maken van de zogenaamde CRISPR-technologie. Deze genoommodificatie technologie stelt ons in staat om met hoge specificiteit veranderingen in het
“epigenoom” aan te brengen en zo de functie van specifieke genen te bestuderen. We willen dit doen in de af- en aanwezigheid van het SMARCB1 gen, door deze met behulp van virussen weer in de tumorcellen in te brengen. Op deze manier hopen we SMARCB1-afhankelijke, en dus tumor specifieke, epigenetische processen te ontrafelen.

Daarnaast gaan we het effect bestuderen van het behandelen van MRT organoïden met – een combinatie van – medicijnen die epigenetische processen in de cel platleggen. We hebben recent laten zien dat het weer “aanzetten” van SMARCB1 in MRT cellen ervoor zorgt dat ze stoppen met delen en veranderen in een
“normale cel” (Figuur A). Genen aan- en uitzetten in patiënten is op dit moment niet mogelijk. Een alternatief zou zijn om een medicijn te vinden die eenzelfde effect heeft (Figuur B). In dit deel van het project willen we onderzoeken of er medicijnen zijn die hetzelfde effect hebben op MRT cellen als het aanzetten van
het SMARCB1 gen. We gaan dit doen door MRT organoïden te behandelen met een grote verzameling van medicijnen die interfereren met epigenetische processen. We zullen de effecten van deze behandelingen bestuderen met behulp van verschillende experimentele read-outs zoals imaging, genexpressie analyses en biochemische analyses. 

Start: Voorjaar 2023
Looptijd: +/- 3 jaar
Status: Loopt
Kosten: circa € 250.000